主动学习免测序发现未知Cas9的PAM

研究提出一套以主动学习算法引导、免测序的 PAM 发现流程，只需数轮迭代切割实验即可确定 Cas9 同源物的 PAM。该流程先在 7 个同源物的公开数据集上验证，Matthews 相关系数不低于 0.8，且在第四轮前统计显著收敛，所需数据量比传统机器学习少最多二十倍。 研究随后在体外用已充分研究的 SpCas9 和 PpCas9 验证流程，经四到七轮切割实验正确识别出 NGG 和 NNNNRT 两种 PAM。将同一方案用于环境 Alkalibacillus 样本中未表征的核酸酶 AlkaCas9，研究称发现了 NNGAV 这一 PAM，并通过逐位随机化的定位扫描加以验证。

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还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。