决策基准评测蛋白模型的实验价值

一篇 bioRxiv 论文提出 decision benchmarking（决策基准评测），在 217 个 ProteinGym 实验、247 万个变体和 95 个预测器上，比较模型预测与实际测量在同等预算下对决策的改进。 论文报告：校准后，zero-shot 准确率只能解释发现效果不到五分之一的差异；校准先验在 20–100 次测量的预算下优于同等成本的加性测量，但优势随测量累积而收窄；在挑选最优变体上，实测加性在 50–100 次测量后反超 zero-shot 模型，在全局排序上约需 500 次测量。

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