纳米孔扩增子测序panel用于间日疟原虫监测
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纳米孔扩增子测序panel用于间日疟原虫监测
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AI 综述
da Silva 等作者团队开发并验证了一套基于 Oxford Nanopore MinION 的 Plasmodium knowlesi 扩增子测序panel与30-SNP条形码,用于常规基因组监测感染来源与动物宿主种群结构,结果保留了大尺度与小尺度的群体遗传结构。 该panel在泰国南部四省2018—2023年采集的28例临床感染样本上完成多重扩增与测序验证:27个位点产出序列数据,23例感染至少有8个位点的数据可用于分析;这23例泰国感染与104个已发表马来西亚基因组共观察到586个多态SNP,新测序的泰国感染中有25个位点具多样性(平均期望杂合度0.69)。
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最新进展10月19日 08:00
基于纳米孔扩增子测序panel解析间日疟原虫感染来源与动物宿主种群结构报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月19日
- medRxiv 临床预印基于纳米孔扩增子测序panel解析间日疟原虫感染来源与动物宿主种群结构
研究开发了一套靶向扩增子测序panel,用于常规基因组监测间日疟原虫(Plasmodium knowlesi)感染的来源与动物宿主种群结构。
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还没有足够的连续观测数据,暂不绘制趋势。