建立纸基3D肿瘤模型分层基因表达分析流程
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建立纸基3D肿瘤模型分层基因表达分析流程
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AI 综述
Kumar 与 Toley 在 bioRxiv 发表论文，针对多层纸-Matrigel 支架中 RNA 难以回收的问题，建立了空间分辨基因表达分析流程。用 MDA-MB-231 乳腺癌细胞比较提取策略时，常规硅胶柱法从复合支架仅得 3.39 ± 0.93 ng/μL RNA，TRIzol-氯仿法提升至 201.13 ± 38.32 ng/μL。 优化后的流程可从八层纸基体外肿瘤模型的各层独立回收 RNA，浓度为 113.06 ± 5.00 至 245.26 ± 15.76 ng/μL，纯度适合下游 qRT-PCR 分析。在 5 μM 阿霉素处理 48 小时的实验中，各处理层与对应未处理层比较，HIF1A 和 VEGFA 表达总体向深层更明显，而相对细胞活力呈非单调的空间分布。
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最新进展10月20日 08:00
论文建立多层纸质3D肿瘤模型的空间分辨基因表达分析流程报道时间线
沿着报道，了解事件的不同侧面。
10月20日
- bioRxiv 生物工程论文建立多层纸质3D肿瘤模型的空间分辨基因表达分析流程
该研究针对多层纸质3D肿瘤模型，解决了细胞负载纸-Matrigel支架中RNA回收的难题，建立了空间分辨基因表达分析流程。使用MDA-MB-231乳腺癌细胞比较多种提取策略，常规硅胶柱法从复合支架仅得3.39 ± 0.93 ng/μL RNA，TRIzol-氯仿法提升至201.13 ± 38.32 ng/μL。
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